Hej
När jag öppnar filen med Iris så verkar nivån i de respektive färgkanalerna ligga mellan 250 och 300 vilket verkar väldigt lågt, nästan nere i brusnivån. Om det värdet är riktigt så är dina flatbilder kraftigt underexponerade och misstanken att histogrammet i din kamera inte är pålitligt kan vara rätt. Men du kanske borde söka en andra uppfattning, jag har ingen erfarenhet av Nikonfiler och Iris är inte alltid 100% pålitligt.
EDIT: Flatbilden är också suspekt flat

... det syns inga gradienter från vinjettering eller andra fenomen vilket det nog borde göra.
Anders